Ho finito finalmente gli ultimi aggiornamenti al webserver Apache.
Oggi ho sistemato il file robots.txt e sitemap.xml.
Dopodichè ho bloccato l’accesso via browser alle cartelle potenzialmente pericolose via apache, e non più via file .htaccess, secondo me più sicuro. Ora tentando di accedere a una di queste cartelle si riscontra il messaggio:

Forbidden
 
You don't have permission to access /directory_bloccata/ on this server.

Per bloccare l’accesso alle directory è sufficiente inserire dentro al VirtualHost di apache quanto segue:

<Directory /percorso/assoluto/cartella>
        Order Deny,Allow
        Deny from All
</Directory>

E successivamente riavviare il demone (/etc/init.d/apache2 restart).